山东大学药学院前身为始建于1920年的齐鲁大学药科，是我国最早成立的高等药学专业院校之一。历经1952年和1955 年全国高等院校调整后于1971年重建。1997年12月升格为山东医科大学药学院。2000年7月，原山东大学、山东医科大学、山东工业大学三校合并组建新的山东大学，更名为山东大学药学院。经过多年的发展，学院的综合实力已跻身于国内同类院校的先进行列，在中国药学领域享有较高的声誉。
学院下设药物化学、药物制剂、药物分析、新药药理、生化与生物技术药物、生药学、天然药物化学、免疫药理与免疫治疗8个研究所;另建有国家糖工程技术研究中心、教育部天然产物化学生物学重点实验室、山东省药物分子设计和创新药物研究重点实验室、山东省中药标准化工程技术研究中心、卫生部临床药师培训基地、山东省执业药师培训中心等多个国家和省部级重点研究和培训机构;拥有"药物化学"国家重点(培育)学科和"药物化学"、"微生物与生化药物"、"药剂学"、"药理学"4个省级重点学科。此外，还与日本东京大学联合成立了"中日药物筛选中心"、与美国TRIPOS公司联合建立了"山东大学-TRIPOS公司联合计算机辅助药物设计实验室";并设有三种国际学术期刊《Bioscience Trends》(SCI收录)、《Medicinal Research Reviews》(SCI收录) 、《Drug Discoveries &Therapeutics》编辑部。
学院现有教职工97人，其中教授32人、副教授18人。现有国家"***计划"特聘专家2人、教育部***讲座教授1人、国家***基金获得者2人、教育部教学指导委员会委员3人、山东省"泰山学者"3人、教育部新世纪优秀人才3人、山东省有突出贡献的中青年专家1人、山东省医药卫生中青年重点科技人才4人，形成了一支结构较为合理的教师队伍和***的学术研究梯队。
学院现有药学博士后科研流动站和药学一级学科博士学位授予点，硕士有药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学、天然药物化学、制药工程学、临床药学、免疫药物学等十个二级学科授予点。拥有生物医药领域工程博士、制药工程领域工程硕士和药学硕士等专业学位授权点，其中制药工程领域工程硕士研究生教育被评选为"全国工程硕士研究生教育特色工程领域"。本科教育拥有药学、制药工程、临床药学(本硕连读)三个专业，涵盖了理、工、医三大门类，贯通了药物的发现、制造和使用三大环节。其中，药学专业为国家级"第一类特色专业建设点"和山东省高等学校品牌专业建设点，药学实验教学中心为山东省实验教学示范中心。
